iMeta公众号文章目录（2024.8.6）

       列表目录

• • iMeta高被引论文
  • 生物信息/微生物组期刊
  • iMeta相关资讯
  • iMetaOmics相关资讯
  • iMeta最新文章中文版+视频
  • iMetaOmics最新文章中文版+视频
  • 第3卷第3期(2024.6)
  • 第3卷第2期(2024.4)
  • 第3卷第1期(2024.2)
  • 第2卷第4期(2023.12)
  • 第2卷第3期(2023.8)
  • 第2卷第2期(2023.5)
  • 第2卷第1期(2023.2)
  • 第1卷第4期(2022.12)
  • 第1卷第3期(2022.9)
  • 第1卷第2期(2022.6)
  • 第1卷第1期(2022.3)
  • iMeta典型文章系列讲座
  • 跟着iMeta学做分析和作图
  • ImageGP使用教程

  iMeta—微生物组与生物信息顶刊

iMeta—微生物组与生物信息顶刊

• iMeta获得首个影响因子，位列微生物学研究期刊全球第一，SCI期刊Top 1%(2024/6/20)
• iMeta创刊宣传片全球首发-中文版(双语字幕)
• iMeta | 23/11/28起被ESCI收录创刊起所有文章，24年将获得首个影响因子
• iMeta | 2023年发文81篇总被引1954次完美收官，因为有你2024将更精彩
• CiteScore 2023发布 | iMeta 位列生物技术/微生物学科一区(Q1)
• iMeta 2023 CiteScore 突破10分！
• 总结2022，迎接2023！iMeta 2022年度最佳综述评选
• iMeta | 2022年发文60篇被引340次完美收官，因为有你2023将更精彩
• 2023中国肠道大会 ｜ iMeta专刊征稿进行中！
• iMeta | 黄源/邓越/苏展豪/辛凤姣-心血管疾病与肠道微生物组专刊征稿
• iMeta期刊34位编委入选2023年全球高被引学者
• iMeta期刊26位编委入选2022年全球高被引学者
• iMeta | 2023年执行副主编入选名单
• iMeta | 2023年杰出/优秀执行副主编
• iMeta | 2022年第一批正式受聘青年编委
• iMeta期刊青年编委招募 (IF 23.7)
• iMeta | 第二批正式受聘青年编委（2023年度）
• iMeta科学编辑招聘启事(可居家办公，弹性工作)
• iMeta姊妹刊iMetaomics(定位IF>10)欢迎投稿！
• iMeta姊妹刊iMetaomics编委招募 (定位IF>10)
• 喜讯 | iMeta被PubMed Central数据库收录
• iMeta：已被谷歌学术(Google Scholar)收录
• iMeta被DOAJ数据库收录！(2022/10/17)
• iMeta期刊3篇文章被PubMed收录
• iMeta被Scopus数据库收录！
• 喜讯 | iMeta正式被ESCI收录！
• iMeta在中国知网（CNKI）中如何被快速检索
• iMeta | 2022年60篇文章平均引用超30次 (2024/1/30)
• iMeta | 被引超3200次，发文188篇，百引耗时10天(2024/5/30)
• iMeta | 被引超2800次，发文179篇，百引耗时16天(2024/4/17)
• iMeta | 被引超2500次，发文164篇，百引耗时12天(2024/3/11)
• iMeta | 被引超2200次，发文156篇，立即指数14.15，百引耗时14天(2024/2/6)
• iMeta | 被引超2000次，发文141篇，立即指数14.20，百引耗时16天(2024/1/7)
• iMeta | 被引超1500次，发文126篇，立即指数11.91，百引耗时18天(2023/10/23)
• iMeta | 被引超1000次，发文115篇，立即指数8.78，百引耗时27天(2023/7/22)
• iMeta | 被引用500次，发文85篇，立即指数5.88，百引耗时38天(2023/2/26)
• iMeta | 被引用400次，发文71篇，立即指数5.63，百引耗时36天(2023/1/19)
• iMeta | 引用300次，发文60篇，立即指数5，百引耗时49天(2022/12/14)
• iMeta | 引用200+，立即指数3.98，百引耗时54天(2022/10/26)
• iMeta创刊花絮-探索未知，永不止步(全球青年编委的祝福)
• iMeta高起点期刊创刊会暨学术研讨会成功举办：宣传片、现场视频、报告直播回放
• iMeta期刊青年编委招募(定位IF>15)
• 致谢 | iMeta 2023年审稿专家名单
• 致谢 | iMeta 2023年审稿专家名单（第二批）
• iMeta | 姚彦坡/鞠峰/崔丽/牛犇主持土壤环境生物安全与健康专刊征稿
• iMeta | 娄翼来/Mendes/Kudrin主持金砖国家土壤微食物网专刊征稿
• 2022年9月最新学术出版透明与最佳行为准则
• iMeta | 百度认证完成，搜索“iMeta”直达出版社主页和投稿链接
• iMeta | 国际标准刊号ISSN印刷版正式确认，双ISSN申请完成
• iMeta 恭祝您新春快乐！
• iMeta | 2023年1月发展报告
• iMeta | 2023年2月数据分析报告：全文下载量再创历史新高
• iMeta | 2023年5月数据分析报告：2023年下载量突破10万次
• iMeta | 2023年8月数据分析报告：全文下载量近30万次
• iMeta | 2023年10月数据分析报告：单月下载量2.9万 再创历史新高！
• iMeta | 2023年12月数据分析报告：全文下载量40万次！
• iMeta | 2024年1月数据分析报告：投稿量较去年同期提高9倍！
• iMeta | 2024年3月数据分析报告：全文单月下载量3.6万 创历史新高！
• iMeta | 2024年4月数据分析报告：全文下载量突破50万！
• iMeta | 2023文章合集
• iMeta | 方法相关文章合集(2407更新)
• iMeta | 生态环境类相关文章合集(2407更新)
• iMeta | 医学相关文章合集(2408更新)
• iMeta | 植物相关文章合集(2408更新)

iMeta高被引论文

• iMeta 高被引论文40篇
• iMeta 最高引论文30篇
• iMeta | Sangerbox: 交互式整合临床生信分析平台
• iMeta | Majorbio Cloud：一站式多组学数据分析平台
• iMeta：高颜值高被引绘图网站imageGP在线发表
• iMeta | 德国国家肿瘤中心顾祖光发表复杂热图(ComplexHeatmap)可视化方法
• iMeta | 中科院生态中心邓晔组发布微生物组网络分析平台iNAP(图文/视频教程)
• iMeta：西农韦革宏团队焦硕等-土壤真菌驱动细菌群落的构建(全文翻译/PPT/视频解读)
• iMeta | 南农沈其荣团队发布微生物网络分析和可视化R包ggClusterNet
• iMeta | 浙大倪艳组MetOrigin实现代谢物溯源和肠道微生物组与代谢组整合分析
• iMeta｜中科院地球环境研究所王云强组解析了草地土壤微生物生活史策略
• iMeta: 南医大余光创组ggtree最新文章-系统发育树存储与可视化的数据结构
• iMeta | 引用7000+，海普洛斯陈实富发布新版fastp，更快更好地处理FASTQ数据

生物信息/微生物组期刊

• 2023年影响因子: 中国大陆SCI收录期刊
• 2023年影响因子: 微生物学期刊
• 2023年影响因子预测: 中国期刊
• 2023年影响因子预测: 环境学科期刊
• 2023年影响因子预测: 食品学科期刊
• 2023年影响因子预测: 生物技术与应用微生物期刊
• 2023年影响因子预测: 生物信息学期刊
• 2023年影响因子预测: 微生物学期刊
• 生物信息/微生物组期刊推荐： mBio
• 生物信息/微生物组期刊推荐：mSystems
• 生物信息/微生物组期刊推荐： ISME Journal
• 生物信息/微生物组期刊推荐：Microbiome
• 生物信息/微生物组期刊推荐： Plant Biotechnology Journal
• 生物信息/微生物组期刊推荐： Genome Biology
• 生物信息/微生物组期刊推荐：Genome Research
• 生物信息/微生物组期刊推荐：Nature Biotechnology
• 生物信息/微生物组期刊推荐：Genomics, Proteomics & Bioinformatics
• 生物信息/微生物组期刊推荐： Gigascience
• 生物信息/微生物组期刊推荐： Bioinformatics
• 生物信息/微生物组期刊推荐： Emerging Microbes & Infections
• 生物信息/微生物组期刊推荐： Journal of Integrative Plant Biology
• 期刊预警：Microbiology Spectrum 是9分刊吗？今年可能只有3分

iMeta相关资讯

• iMeta 2024大湾区编委会顺利召开
• iMeta 系列论坛-2024 年南京地区青年编委学术研讨会
• iMeta 系列论坛-2024 年北京地区青年编委学术研讨会
• iMeta微生物组工具集专刊征稿：生物信息学、生物技术和宏组学方法
• iMeta | 微生物组工具虚拟专刊发布
• 惊人！iMeta发表文章被166个国家和地区下载104215人次！单篇最高10000+人次！
• iMeta | 引用每百次打卡，立即指数 > ISME、NAR等期刊2倍
• iMeta | 英文新媒体推特(twitter)主页关注人数破千(22/10/1)
• iMeta公众号关注人数破万
• iMeta公众号关注人数破4万
• iMeta | FSCapture报告录屏和视频剪辑(视频教程)
• iMeta | EndNote调整完美引文格式教程
• Publons：文章审稿、编辑工作认证平台
• 如何投稿iMeta期刊？ScholarOne投审稿系统作者使用教程
• 报告视频录制：腾讯会议录屏+人像画中画特效
• 高影响力期刊iMeta扬帆起航(微生物组&生物信息)
• iMeta被Scopus数据库收录！
• iMeta入驻ResearchGate学术社交平台助力期刊国际化发展
• iMeta：已被谷歌学术(Google Scholar)收录
• iMeta期刊投审稿系统ScholarOne正式上线
• iMeta期刊12名编委入选科睿唯安2021年度高被引学者
• iMeta宏基因组&生物信息期刊-创刊背景和简介
• iMeta期刊顾问James M Tiedje当选中国科学院外籍院士
• 中国大陆SCIE收录期刊分析：多少本刊？发文多少？解决了多大内卷？未来在哪里
• 微生物领域SCIE期刊分析(英美各40本，中国大陆0本)
• 如何激活成功教程中国95%SCI论文外流的困局
• Wiley开放科学大使访谈——刘永鑫
• iMeta | 2023年度“最佳研究”评选
• iMeta | 2023年度“最佳研究”评选结果
• iMeta | 2023年度“最佳方法”评选
• iMeta 2023年度“最佳方法”评选结果
• iMeta | 2023年度“最佳综述”评选
• iMeta | 2023年度“最佳综述”评选结果
• iMeta | 2023年度“最佳图文摘要”评选
• iMeta | 2023年度“最佳图文摘要”评选结果
• iMeta 2022年度最佳方法评选
• iMeta 2022年度最佳研究评选
• iMeta 2022年度最佳综述评选
• iMeta 2022年度最佳图文摘要评选
• iMeta 2022年度“最佳综述”评选结果
• iMeta 2022年度“最佳研究”评选结果
• iMeta 2022年度“最佳方法”评选结果

iMetaOmics相关资讯

• 出版社iMetaOmics主页正式上线！
• iMeta姊妹刊iMetaOmics主编正式官宣
• iMeta姊妹刊iMetaOmics投稿系统正式上线（2024.4.17）
• iMeta姊妹刊iMetaOmics电子版和印刷版ISSN申请获批
• iMeta姊妹刊iMetaOmics编委招募 (定位IF>10)
• iMeta姊妹刊iMetaOmics(定位IF>10)欢迎投稿！

iMeta最新文章中文版+视频

• iMeta | OmicShare tools: 交互式的在线生物数据分析与可视化工具
• iMeta | 首都儿科所王毅等揭示布鲁氏菌病患者转录组图谱
• iMeta | 浙大刘建新组-破译瘤胃微生物的功能群及其在塑造宿主表型中的潜在因果关系
• iMeta | 南农王一鸣组揭示稻瘟病及稻曲病微生物防御机制
• iMeta | 首医钟久昌组-缬沙坦通过肠道菌群改善高血压靶器官损伤
• iMeta | 张和平团队-对肠道-乳腺轴的深入解析：母乳源益生菌Probio-M9可缓解乳腺炎并增强抗生素效果
• iMeta | 卢洪洲/陆蒙吉/张继明/王俊-构建贝叶斯多组学分析模型探索肝内炎症发生机制
• iMeta | 中国科学院宋默识/王军-补充婴儿双歧杆菌可减轻心肌缺血再灌注损伤
• iMeta | 韦革宏/焦硕-体型更小的土壤微生物在扰动下维持更高的稳定性和功能
• iMeta | 康奈尔大学郭春君组开发非模式肠道菌基因编辑工具
• iMeta | 浙江大学联合多家医院构建重症肺炎微生物组千人队列
• iMeta | 美吉生物云平台2024年全新升级
• iMeta | 吴松锋/李京丽/朱云平-联合开发在线蛋白质组数据分析平台
• iMeta | 之江实验室/农科院基因组所联合开发CRISPR/Cas12a检测体系crRNA智能设计平台
• iMeta | 唐海宝/张兴坦-用于比较基因组学分析的多功能分析套件JCVI
• iMeta | 陈卫华/王燕-基于口腔宏基因组的牙周炎的通用特征分析研究
• iMeta | 首都医科大学陈汉清-肠道菌群靶向纳米药物治疗结直肠癌的挑战与机遇
• iMeta | 高峥/刘永鑫-微生物介导的植物跨时空通讯
• iMeta | 浙江省农科院杨华/肖英平组-鸭肠道微生物参考基因组及与肠道区域、发育阶段和饲养条件相关的菌群特征

iMetaOmics最新文章中文版+视频

• iMetaOmics | 陈汉清/陈俊综述有关肝细胞癌治疗的新兴纳米医学策略
• iMetaOmics | 杜娟/林婷婷-慢性泪囊炎患者眼部菌群类型和纵向菌群变化
• iMetaOmics | 张开春组利用多组学方法揭示甜樱桃加倍后果色变化的候选基因
• iMetaOmics | 暨南大学潘永勤/杨华组-炎症蛋白联合检测有利于诊断甲状腺乳头状癌和结节性甲状腺肿
• iMetaOmics | 张勇/李福平-先进糖蛋白组学在男性生殖研究中的潜在应用
• iMetaOmics | 浙大张天真组完成二倍体棉种泛基因组构建
• iMetaOmics | 中科院动物所金坚石组综述16S rRNA基因扩增子测序技术的“前世今生”
• iMetaOmics | 徐州医科大杨欢组揭秘沙门氏菌-宿主-微生物群在免疫与代谢中的相互作用
• iMetaOmics | 罗鹏/袁硕峰/苗凯/程全发表STAGER: 生成式人工智能可靠性的标准化测试和评估推荐
• iMetaOmics | 浙江大学宗鑫组揭示两猪种宿主-肠道菌群互作差异

第3卷第3期(2024.6)

• iMeta期刊 第3卷第3期 在线正式发布
• iMeta | 金双侠/张勇等开发棉花基因编辑工具CRISPR/Mb2Cas12a
• iMeta | 季福绥/金鹏飞/陈章然-论述非传统有益菌用于活菌药物开发的可行性
• iMeta | 张国庆/王风平/赵国屏/王寅炤-基于海洋宏基因组数据研究微生物多样性、功能和生物地理学的交互式平台
• iMeta | 魏泓/卞修武/周亚红提出一种新的药物-微生物相互作用评估系统和研究策略
• iMeta | 安医大徐建光/张亨国组-口腔微生物工程化在心血管疾病治疗中的应用与前景
• iMeta | 西北农林曹阳春组综述艰难梭菌感染中的宿主免疫反应：对病原学和免疫治疗的意义
• iMeta | 山一大李乐平/种微识别胃癌铜死亡特征相关分子亚型
• iMeta | 大连工大夏效东组揭示嗜黏蛋白阿克曼菌可通过增加肠道亚油酸水平增强小鼠抗李斯特菌感染的能力
• iMeta | 广西医科大安三奇等开发肠道疾病多组学数据库GutUDB
• iMeta | 李地艳/刘永鑫/毛如荣揭示阴道微生物群影响不孕症女性体外受精的妊娠结局
• iMeta | 清华李炳组-联用宏病毒组和宏基因组解译污水厂病毒圈
• iMeta | 农科院资划所刘卫星组揭示氮富集条件下土壤细菌性状介导网络复杂性的机制
• iMeta | 重医大沈伟等发布全能序列处理工具SeqKit2
• iMeta | 最全可视化韦恩图和集合图工具EVenn使用手册
• iMeta | 武汉理工方临川组揭示以丛枝菌根真菌为中心的退化生态系统恢复新机制
• iMeta | 南科大杨亮/刘洋-开发研究细菌DNA甲基化组及其转录调控工具Bacmethy

第3卷第2期(2024.4)

• iMeta期刊 第3卷第3期封面：双管齐下
• iMeta期刊 第3卷第3期封底：一种新的药物-微生物相互作用评估系统和研究策略
• iMeta期刊 第3卷第2期 在线正式发布
• iMeta期刊 第3卷第2期封面：非土著益生菌在鱼类上的应用风险
• iMeta | 中国农科院深圳基因组所陶永富组完成高粱T2T基因组组装
• iMeta | 农科院饲料所周志刚组以鼠李糖乳杆菌GG致损斑马鱼肠道为例揭示益生菌（益生作用）宿主依赖机制
• iMeta | SIDERITE：全面揭示化学空间隐藏的铁载体
• iMeta | 刘杏忠团队揭示长期连作缓解烟草连作障碍的微生物机制
• iMeta | 基因组所刘永鑫组联合全球95家单位合作倡议发起微生物组实验手册第二版
• iMeta | 浙江省农业科学院李有贵团队揭示桑黄多酚抗结肠炎肠道分子机制
• iMeta | 探究人体肠道菌群与口服降糖药之间相互作用的特性与共性
• iMeta | 刘金鑫/徐珂琳/张安云-揭示生命早期微生物碳水化合物代谢的改变
• iMeta | 上海交大刘宁宁组综述癌症进展中”营养-真菌-宿主”三方的相互作用
• iMeta | 王继刚/戴凌云/徐承超/韩光-基于光亲和标记策略鉴定青蒿素在恶性疟原虫红细胞内期中的抗疟靶标
• iMeta | 华大研究院邹远强/肖亮揭示毛螺菌科多样性
• iMeta编辑部和湘湖实验室联合发表ChatGPT与生成式AI的高效使用方法和使用规范
• iMeta | 北大深圳医院桂耀庭组揭示弱精子症患者精浆微生态的动态变化及核心代谢物十六酰胺的作用机制
• iMeta | 熊长明/郑乐民/杨跃进揭示肠道菌群在肺动脉高压中的神秘面纱
• iMeta | 黄小罗/戴俊彪等开发 DNA 数据存储用户友好型平台：Storage-D
• iMeta | 山东大学张群业组综述肠道菌群与妊娠并发症：当前见解与未来展望

第3卷第1期(2024.2)

• iMeta期刊 第3卷第1期 在线正式发布
• iMeta | 佛山科学技术学院李英组-大熊猫肠道微生物抗生素抗性基因宿主和表达模式
• iMeta | 中科院免疫感染所高义舟等阐述胎粪中的细菌载量
• iMeta | 李梅/韦中等揭示合成微生物群落在提升土壤健康研究中的应用进展
• iMeta | 清华大学刘锐平组利用几何深度学习揭示光控反硝化微生物组的应用
• iMeta | 河南农大家禽团队-鸭泛基因组研究揭示转座子插入是影响体重和白羽性状的原因突变
• iMeta | 更好的ggVennDiagram, 更好用的韦恩图工具
• iMeta | 华中农大陈振夏组揭示黑米饮食对结直肠癌发展的健康效用及潜在机制
• iMeta | 基因组所刘永鑫组与微科盟合作开发宏组学数据在线分析平台
• iMeta | 华北理工宋小明组开发植物激素相关基因数据库PHGD
• iMeta | 南昌大学聂少平组-葡甘露聚糖通过调节肠道共生菌改善胰岛素抵抗
• iMeta | 中国农科院环发所娄翼来研究员在“土壤微食物网”方面取得研究进展
• iMeta | 浙江农科院肖英平组揭示肠道微生物影响猪脂肪沉积的作用机制
• iMeta | 天津大学高峰组：必需基因特性表征与相关数据库开发的研究进展
• iMeta | 中山大学谢小明/伍民庆/邹宇田综述肠道菌群重塑癌症免疫治疗疗效: 机制和治疗策略
• iMeta | 华南农大孙坚组揭示了猪场日常职业暴露对人皮肤微生物组和耐药组的影响
• iMeta | 广东省人民医院张学礼等更新结直肠癌生物标志物数据库CBD2

第2卷第4期(2023.12)

• iMeta期刊 第2卷第4期 在线正式发布
• iMeta期刊 第2卷第4期封面：解码先天性心脏病患者肠道微生态奥秘
• iMeta期刊 第2卷第4期封底：肠道稳态
• iMeta | 华中科大宁康组与元码基因联合开发在线微生物关联分析平台
• iMeta | 浙江大学邵勇奇组揭示引物选择影响环境微生物组的微生态模式评估
• iMeta | 尤祥伟/李义强团队-揭示水热炭调控滨海盐碱土固碳减排新机制
• iMeta | 东北林业大学冯富娟组发现丛枝菌根真菌诱导削弱镉的迁移
• iMeta｜香港中文大学（深圳）及福田生物医药创新研发中心与海普洛斯联合推出单细胞分析流程ScRNAPip
• iMeta | 江南大学陈卫课题组探究清酒乳杆菌对炎症性肠病的种间差异机制
• iMeta | 厦门大学游伟伟组开发具备Shinyapp界面的一站式转录组分析和可视化R包
• iMeta | 中国科学院微生物所魏鑫丽组揭示荒漠地衣结皮中关键细菌具宿主选择趋势
• iMeta | 中科院水保所邓蕾组揭示了长期植被演替下土壤活性碳组分与微生物群落的联系
• iMeta | 解放军总医院卫勃组-褪黑素延长创伤性结肠损伤个体生存时间的新作用及相关机制
• iMeta | tNGS利器：跨物种超多重靶向测序引物设计软件MultiPrime
• iMeta | 朱永官院士团队苏建强组-空气丰富与稀有种对大气环境变化的响应
• iMeta | 中科院微生物所王军组-MetaSVs：结合长、短reads用于宏基因组结构变异分析和可视化流程
• iMeta | 上海市食药检院/美吉生物-MIST: 可交互微生物鉴定和溯源分析平台
• iMeta封面 | 阜外医院李守军/黄源/刘禹泽-解码先天性心脏病患者肠道微生态奥秘
• iMeta | 安徽医科大梁朝朝组基于多组学数据揭示肾透明细胞癌分子分型
• iMeta | 南京大学陈迪俊组开发了可用于构建基因动态调控和网络的整合分析平台

第2卷第3期(2023.8)

• iMeta期刊 第2卷第3期在线正式发布
• iMeta期刊 第2卷第3期封面：植物病害之隐秘推手
• iMeta | 青岛大学朱素杰组开发了基于集成学习的新冠患者疾病严重程度打分
• iMeta | 罗鹏/袁硕峰/张健/程全-合作开发用于探索HPV相关肿瘤的肿瘤免疫微环境的shiny网页工具
• iMeta | 杨跃进/熊长明/郑乐民综述琥珀酸的多效性：肠道菌群与心血管疾病的相互作用
• iMeta | 索尔克研究所丁武斌开发可视化多模态基因组学数据的python包 教程
• iMeta | 中国海洋大学张伟鹏组揭示海洋微塑料表面生物被膜组装机制
• iMeta | 中山大学李文均教授团队描绘不同极端环境原核微生物培养策略
• iMeta | 齐素华/顾兵/罗兰/王亮-揭示玛咖来源细胞外囊泡可通过脑-肠轴促进五羟色胺释放改善抑郁症
• iMeta | 威斯康星大学周之超开发模块化工具研究病毒组
• iMeta | 刘吉泉/徐健-揭示洗涤过程中抗菌洗涤剂对衣物中微生物交换及后续异味的影响
• iMeta | 徐健/姚粟/崔云龙-合作发明基于拉曼组原理的益生菌单细胞质检技术
• iMeta | 浙江大学王蒙岑组综述植物发病机制：走向对微生物组的多维理解
• iMeta | 中国药科大学李萍/李菁-编码胆盐水解酶的乳酸杆菌的分类鉴定：调节肝肠胆汁酸谱
• iMeta | 韩新巍/张振宇/刘灶渠基于免疫扰动网络揭示胶质母细胞瘤的生物学异质性
• iMeta | 北京协和医学院张健/张宇辉综述心力衰竭中的肠道菌群及相关干预措施
• iMeta | 内蒙古大学包玉英组揭示火山极端环境下不同岩石表层土壤微生物组的模式和驱动因素

第2卷第2期(2023.5)

• iMeta期刊 第2卷第2期 在线正式发布
• iMeta期刊 第2卷第2期封面：肠道菌群之歌
• iMeta | 中国农业大学胡永飞组揭示鸡肠道微生物发育轨迹及其与宿主代谢的关系
• iMeta | 南方医科大学刘志华揭示高盐饮食诱导突触丧失和记忆损伤
• iMeta | 瑞典卡罗林斯卡医学院杜娟团队揭示宫颈异常增生患者唾液菌群发生改变且受锥形切除术治疗的影响
• iMeta | 引用7000+，海普洛斯陈实富发布新版fastp，更快更好地处理FASTQ数据
• iMeta | 复旦大学附属华山医院证实肾上腺皮质癌中瘤内菌的存在并与预后相关
• iMeta | 军事医学研究院杨瑞馥组开发IMBEC技术用于分离结直肠癌患者体内的致病共栖菌
• iMeta |中科院南京土壤所褚海燕组开发量化微生物群落水平生物关联的方法
• iMeta | 华中科技大学杨操组综述细胞外囊泡和微生物组的互作：疾病治疗新策略
• iMeta | 西北农林科技大学韩新辉组揭示降水变化对土壤微生物网络复杂性和多功能性的影响
• iMeta | 张彦琼/许海玉/周雪忠联合开发基于SoFDA病-证-方关联的本体表征、富集分析和相似度计算评价
• iMeta | 河南农业大学姚文组开发绘制Circos图的交互式Web应用程序
• iMeta |吴小立/谢黎炜综述肠道菌群可能作为精神分裂症和肥胖症发病机制的共同枢纽
• iMeta | 中科院城市所杨军团队揭示城市公园微生物迁移对生物多样性和生态功能的影响
• iMeta | 中国农业大学汪杰组“塑料际”微生物最新综述
• iMeta | 格罗宁根大学傅静远组发表对于Nature微生物菌株传播研究的评论
• iMeta | 南方医科大学谢黎炜、马颖联合发现新生儿肠道微生物网络结构变化规律
• iMeta | 浙大吴顶峰和同济刘蕾等对微生物富集分析中Reporter Score的误用研究
• iMeta | 印遇龙院士/郑大魏勇军等综述益生菌发酵中草药的研究进展
• iMeta | 调控肠道菌群的宿主源代谢分子概述
• iMeta | 西湖大学郑钜圣团队：妊娠期糖尿病队列研究方案

第2卷第1期(2023.2)

• iMeta期刊 第2卷第1期 在线正式发布
• iMeta期刊 第2卷第1期 封面正式发布
• iMeta | 兰州大学张东青年研究员：使用PhyloSuite进行分子系统发育及系统发育树的统计分析
• iMeta | 宁波大学附属第一医院崔翰斌团队综述缺血性心脏病相关肠道微生物及菌群代谢物研究进展
• iMeta | 2022年iMeta进展与审稿人致谢
• iMeta | 中科院植物所周世良团队和河北工程大学刘艳磊团队揭示现代丝绸之路东段植物物种多样性格局及其影响因素
• iMeta | 易扩增子(EasyAmplicon)：易用、可重复的微生物组扩增子分析流程
• iMeta | 李香真/姚敏杰开发微生物共现网络比较流程
• iMeta | OmicStudio：一款可组合的、即时反馈的可生成高质量的发表级图表的生物信息云平台
• iMeta | 农科院资划所曹卫东组揭示种植利用豆科绿肥内源驱动土壤自生固氮的作用
• iMeta | 北中药李晓骄阳组综述解码免疫T细胞的作用-改善代谢相关脂肪性肝病的新领域
• iMeta | 中科院武汉植物园杨玉义组探究浮游生物应对城市湖泊藻华加剧的分化策略
• iMeta | 兰州大学刘勇勤组揭示植物定殖对冰川前缘微生物群落动态的影响
• iMeta | 南京农业大学韦中组开发多病原生物污染高通量快检平台
• iMeta | 南科大夏雨组综述二三代宏基因组分析的策略和工具(Illumina & Nanopore)
• iMeta | 俄亥俄州立大学郑庆飞组发表多组学方法研究肿瘤微生物组综述
• iMeta | 山东大学刘建团队–盐度胁迫削弱了微生物世界的马太效应
• iMeta｜哈佛医学院刘洋彧组揭示生态动力学对微生物溯源的挑战
• iMeta｜暨南大学陈嘉莉/白卫滨综述高脂饮食介导的肠菌紊乱与慢性疾病的互作机制
• iMeta | 西悉尼大学刘洪伟/张海洋-温暖和干燥环境选择基因组较小的细菌
• iMeta｜南医大刘星吟组研发微生物绝对丰度变化新方法(QMD)
• iMeta | 大连海洋大学傅松哲和根特大学杨倩开发宏基因组测序和流式细胞术相结合的工作流程
• iMeta | 中科院地球环境研究所王云强组解析了草地土壤微生物生活史策略
• iMeta | 湘雅医院刘庆组-泛癌分析揭示铜死亡调节子的临床和分子特征

第1卷第4期(2022.12)

• iMeta | 第1卷第4期来自8个国家的20篇文章正式发布(2022.12)
• iMeta | 原核微生物泛基因组与基因组分析平台IPGA
• iMeta | 中科院南京土壤所吴永红组揭示周丛生物非生物成分的地理印记和生态功能
• iMeta | mibPOPdb: 华中科技大学张后今开发微生物降解数据库
• iMeta｜中科院微生物所刘双江组发布人源毛螺菌科菌株资源库和菌株水平代谢谱
• iMeta | 水科院南海所姜敬哲/中大施莽利用病毒组揭示的牡蛎体内的新型RNA病毒
• iMeta | 中国农大杨栋组揭示膳食纤维化学结构对肠道微生物的调控
• iMeta | 同济大学朱瑞新团队靶向基石菌种可恢复非酒精性脂肪肝中失调的产丁酸菌
• iMeta | 中科院上海巴斯德所崔杰组综述海洋RNA病毒圈的二十年研究
• iMeta | 扬州大学杜予州团队揭示同域内同食物的两种昆虫肠道微生物群落装配机制
• iMeta | 南医大余光创组ggtree最新文章-系统发育树存储与可视化的数据结构
• iMeta | 中科院南土所褚海燕组揭示真菌对高寒林线多界生物群落的稳定作用
• iMeta | 中农马曦组综述肠道菌群与干细胞巢互作维持肠内稳态平衡
• iMeta | 德加合作揭示葛藤菌根真菌的遗传多样性和群落组成
• iMeta | 华科宁康等打通中药成分鉴定和网络药理分析，助力中药标准化数字化国际化
• iMeta | 浙大蒋超组综述环境暴露组全景景观图
• iMeta | 成都中医药大学张杨组开发抗新冠中医药及其机制与疗效数据库
• iMeta | 青岛华大范广益组基于共标签测序数据的高质量宏基因组组装工具MetaTrass
• iMeta | 厦门大学马永慧组探究捐菌者对肠菌移植的伦理认知和态度

第1卷第3期(2022.9)

• iMeta | 第1卷第3期来自8个国家的14篇文章正式发布(2022.9)
• iMeta | 南农沈其荣团队发布微生物网络分析和可视化R包ggClusterNet 教程 计算网络稳定性
• iMeta | 德国国家肿瘤中心顾祖光发表复杂热图(ComplexHeatmap)可视化方法 这是世界上最短的引文？
• iMeta | 海南大学张家超组-基于肠道菌群SNV基因标记物的炎症性肠病预测模型
• iMeta | 深圳先进院戴磊组开发可同时提取共存菌株的组成和基因成分谱的菌株分析工具 视频教程
• iMeta | Sangerbox: 交互式整合临床生信分析平台
• iMeta | 短读长扩增子测序是否适用于微生物组功能的预测？
• iMeta | 林雁冰/James M. Tiedje/谷洁等揭示菌群对寄生植物列当的调控作用
• iMeta | 东农吴凤芝/南农韦中等揭示生物炭抑制作物土传病害机理
• iMeta | 华南农大陈程杰/夏瑞等发布TBtools构造Circos图的简单方法
• iMeta | 叶茂/时玉等综述环境微生物组中胞内与胞外基因的动态穿梭与生态功能
• iMeta | 华南师大王璋组综述人体肺部微生物组与人类健康和疾病之间的隐秘关联
• iMeta | 中农李季组揭示有机农业长期定位试验番茄微生物组结构
• iMeta | 新加坡城市污水处理厂中流式细胞仪分类群落和鸟枪法病毒宏基因组学的比较研究

第1卷第2期(2022.6)

• iMeta | 第1卷第2期 在线正式发布(2022.6)
• iMeta | 中科院生态中心邓晔组发布微生物组网络分析平台iNAP
• iMeta | 南京医科大学孔祥清团队创建前瞻性多组学纵向原发高血压队列eHypertension
• iMeta | Majorbio Cloud：一站式多组学数据分析平台
• iMeta | 南医大陈连民/孔祥清等综述从基因组功能角度揭示肠菌对复杂疾病的潜在影响
• iMeta | 北大陈峰组综述口腔微生物组的标准化研究：从技术驱动到假说驱动
• iMeta封面 | 宏蛋白质组学分析一站式工具集iMetaLab Suite(加拿大渥太华大学Figeys组) 1小时视频教程+PPT
• iMeta | 北大陈峰/陈智滨等发表口腔微生物组研究中各部位取样的实验方法(Protocol)
• iMeta | 南昌大学丁霞等-水产养殖系统对中华鳖微生物组和肠道代谢组的影响
• iMeta｜西工大钟杨权威等-根系菌群沿环境梯度的响应机制
• iMeta | 深圳先进院马迎飞组开发基于神经网络分析肠道菌群的方法
• iMeta | 华南农大曾振灵/熊文广等-家庭中宠物犬与主人耐药基因的共存研究
• iMeta | 南科大夏雨组纳米孔测序揭示微生物可减轻高海拔冻土温室气体排放

第1卷第1期(2022.3)

• iMeta | 第1卷第1期在线正式发布(2022/3/28)
• iMeta | 高颜值高被引绘图网站imageGP
• iMeta: 整合宏组学重新认识生命和环境科学
• iMeta | 吴青龙/王明福/刘金鑫等-从肠道菌群看待人类对高原饮食的适应性
• iMeta | 德布鲁因图在微生物组研究中的应用
• iMeta | 南科大宋毅组综述逆境胁迫下植物向微生物组求救的遗传基础
• iMeta | 华中科大宁康组综述用于蛋白质结构预测的宏基因组定量分析
• iMeta | 电子科大林昊组开发蛋白质赖氨酸乳酸化位点预测工具DeepKla
• iMeta | 青岛大学苏晓泉组开发跨平台可交互的微生物组分析平台
• iMeta | 西农韦革宏团队焦硕等-土壤真菌驱动细菌群落的构建
• iMeta | 哈佛刘洋彧等基于物种组合预测菌群结构的深度学习方法
• iMeta | 中科院李小方等膳食甘草促进小鼠镉解毒并调节肠道菌群代谢
• iMeta | 浙大倪艳组MetOrigin实现代谢物溯源和肠道微生物组与代谢组整合分析 视频教程

iMeta典型文章系列讲座

• 施春林 | iMeta期刊及文章发表(南京医科大学,7月9日14点)
• iMeta 讲座9 | 文涛-ggClusterNet在微生物组网络分析中的应用
• 视频回放 | 文涛-ggClusterNet在微生物组网络分析中的应用
• iMeta典型文章系列讲座八：顾祖光-组学数据分析和可视化工具开发
• 视频回放 | 顾祖光-组学数据分析和可视化工具开发
• 视频回放 | 朱穗-医学统计数据常见分析方法及其误用
• iMeta讲座 | 朱穗-医学统计数据常见分析方法及其误用
• 视频回放 | 蒲中机-生成式人工智能的科研实践与应用
• iMeta典型文章系列讲座六：蒲中机-生成式人工智能的科研实践与应用
• 施春林 | iMeta期刊文章发表(12/26下午2点湘湖实验室)
• 视频回放 | iMeta格式跟进介绍
• 报告 | 刘永鑫: 高影响力文章特点及如何支持国刊发展(12月14日20:00)
• 视频回放 | 刘永鑫: 高影响力文章特点及如何支持国刊发展
• iMeta典型文章系列讲座四：焦硕-土壤真菌驱动细菌群落的构建
• 视频回放: 焦硕-土壤真菌驱动细菌群落的构建
• iMeta典型文章系列讲座三：吕天星-作物微生物组
• 视频回放: 吕天星-作物微生物组
• iMeta典型文章系列讲座二：陈同-高被引绘图网站imageGP
• 视频教程：陈同-高被引绘图网站imageGP
• iMeta典型文章系列讲座一：胡永飞-鸡肠道菌群结构与功能
• 胡永飞：定量微生物组揭示鸡肠道微生物发育轨迹及其与宿主代谢的关系（含视频/PPT）

跟着iMeta学做分析和作图

• 科研指南 | Dimensions数据库功能查询教程
• 冲击图展示菌群随盐度的变化
• 山峦图展示微生物丰度随盐度增加的动态变化
• 环境因子在地图上的可视化
• 如何用python画世界地图，并用不同的颜色展现每个国家的数据？
• ggplot2绘制相关性分析线面组合热图
• 双侧柱状图展示具有正负相关性的类型数量
• 跟着iMeta学做图｜用三元图展示微生物种群相对丰度
• 分面箱线图展示alpha多样性并用标注差异分析结果
• ggplot2包绘制棒棒糖图展示变量间的相关性
• 绘制基于非加权Unifrac距离的主坐标分析PCoA图
• ComplexHeatmap包绘制热图展示不同样本物种相对丰度
• 用ggClusterNet绘制共现网络（Co-occurrence Network）
• circlize绘制环状热图展示细菌功能聚类分析
• NMDS分析展示群落beta多样性
• 群落微生物与环境因子相关性分析
• circlize绘制和弦图展示样本物种相对丰度
• ggplot2绘制多个饼图展示菌群物种组成
• 微生物组共现网络（Co-occurrence Network）绘制
• ggplot2绘制曼哈顿图展现物种丰度差异
• 跟着iMeta学做图｜ComplexHeatmap绘制多样的热图
• 世界海拔地图
• 使用ImageGP绘图热图Heatmap
• 使用ImageGP绘图富集分析泡泡图
• 使用PMS分析微生物组(图文+视频)
• DeepKla预测赖氨酸乳酸化位点

ImageGP使用教程

• 分享高颜值免费在线绘图介绍和使用的一次视频直播
• 视频演示 | 如何解读和在线绘制进化树并添加属性注释？
• 视频演示 | WGCNA加权共表达分析在线操作
• 视频演示 | ImageGP重新绘制WGCNA性状关联热图
• 视频演示 | 在线差异基因/物种分析
• 视频演示 | 画个火山图，标记下基因的名字
• 视频演示 | BIC无代码绘制差异基因火山图
• 视频演示 |点点鼠标在线绘制GO/KEGG富集分析泡泡图
• 视频演示 | Meta-gene图谱在线绘制
• 视频演示 | 高颜值免费在线绘图工具功能预览和帮助预览
• 视频演示 | 在线轻松绘制配对连线箱线图
• 简单强大的在线绘图
• 简单强大的在线绘图-升级版
• 简单强大的在线绘图-第3版
• 在线WGCNA分析 （直接出交互式结果报告）
• 在线差异基因分析 （支持自动和指定批次校正）
• 这个工具可以组合参数画出2种单细胞Marker显示图
• 高颜值免费在线SCI绘图工具增加上传功能
• ImageGP新上几个小工具
• 如何保证文章中同一组样品在不同子图颜色一致？
• 推荐一款生信分析工具的集大成者
• 视频演示 | 功能新增 | 增强版在线LEFSe分析和可视化鉴定标志性基因或物种
• Venn网络展示富集分析结果
• 单个基因集富集分析泡泡图绘制
• 多个基因集富集结果泡泡图绘制展示
• 无代码调整聚类热图分支顺序
• 基因表达热图聚类并增加行列注释
• 热图绘制一个快乐五一
• 轻轻松松画个热图
• 续昨天的文章，在火山图标记基因名字
• 画个火山图，标记下基因的名字
• 无代码绘制基因表达箱线图
• 什么是倾斜45度的火山图？
• 在线直接绘制倾斜45度的“火山图”
• 在线进行 PCoA 分析和相关统计检验

更多推荐

（▼ 点击跳转）

高引文章 ▸▸▸▸

iMeta | 引用13000+，海普洛斯陈实富发布新版fastp，更快更好地处理FASTQ数据

高引文章 ▸▸▸▸

iMeta | 德国国家肿瘤中心顾祖光发表复杂热图(ComplexHeatmap)可视化方法

高引文章▸▸▸▸

iMeta | 高颜值绘图网站imageGP+视频教程合集                                        

1卷1期

1卷2期

1卷3期

1卷4期

2卷1期

2卷2期

2卷3期

2卷4期

3卷1期

2卷2期封底

2卷4期封底

3卷2期

3卷3期

3卷3期封底

期刊简介

“iMeta” 是由威立、肠菌分会和本领域数百千华人科学家合作出版的开放获取期刊，主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述，重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等。目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。期刊特色包括视频投稿、可重复分析、图片打磨、青年编委、前3年免出版费、50万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊发行！发行后相继被Google Scholar、ESCI、PubMed、DOAJ、Scopus等数据库收录！2024年6月获得首个影响因子23.7，位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848)，微生物学科2/161，仅低于Nature Reviews，同学科研究类期刊全球第一，中国大陆11/514！

“iMetaOmics” 是“iMeta” 子刊，主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任，是定位IF>10的高水平综合期刊，欢迎投稿！

iMeta主页：

http://www.imeta.science

姊妹刊iMetaOmics主页：

http://www.imeta.science/imetaomics/

出版社iMeta主页：

https://onlinelibrary.wiley.com/journal/x

出版社iMetaOmics主页：

https://onlinelibrary.wiley.com/journal/

https://wiley.atyponrex.com/journal/IMT2

iMetaOmics投稿：

https://wiley.atyponrex.com/journal/IMO2

邮箱：