推荐两个植物miRNA数据库(miRbase和PNRD)

推荐两个植物miRNA数据库(miRbase和PNRD)本文介绍了植物 miRNA 数据库 miRBase 和 PNRD 强调了它们在 miRNA 序列 注释 靶基因预测 表达模式以及 ncRNA 分析等方面的功能

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前记

植物miRNA数据库是储存和整理植物微小RNA(miRNA)相关信息的数据库。miRNA是一类长度为21-24个核苷酸的非编码小分子RNA,能够通过与靶基因的mRNA结合,调控基因表达。植物miRNA数据库通常包含以下内容:

  1. miRNA序列信息:数据库中储存了已知的植物miRNA序列信息,可以通过搜索或浏览功能查找感兴趣的miRNA。
  2. 靶基因预测:数据库通过预测和分析miRNA与靶基因的互作关系,提供了植物miRNA靶基因的预测结果。这些预测结果可以帮助研究者了解miRNA的功能和调控机制。
  3. 表达谱和调控网络:数据库中可能还包含miRNA的表达谱数据,用于了解miRNA在不同组织或生物过程中的表达模式。此外,一些数据库还会展示miRNA参与的调控网络,帮助研究者了解miRNA与其他基因之间的相互作用。
  4. 相关文献和资源链接:植物miRNA数据库通常会提供相关的文献引用和资源链接,帮助用户进一步了解和探索miRNA的研究领域。

常见的植物miRNA数据库包括miRBase、miRDB、PmiREN等,用户可以根据自己的需求选择合适的数据库进行使用。

本文介绍两个好用的数据库,miRBase和PNRD。 

一、miRBase

mi

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