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MSTP的实例具有特殊的作用，称为CIST（Common and Internal Spanning Tree），即公共与内部生成树，其他的实例称为MSTI（Multiple Spanning Tree Instance），即多生成树实例。CIST由通过STP/RSTP计算得到的单生成树和MSTP计算得到的域组成，是为了保证在所有桥接的局域网是简单的和全连接的。是连接一个交换网络内所有设备的单生成树，由IST和CST共同构成.
由上可知，从包含的范围来看，IST是最小的，仅属于一个MST区域内部，CST次之，则是MST区域间的互联生成树实例，而CIST则最大，包括了IST和CST.
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