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samtools安装过程
samtools是用于处理序列对比输出sam与bam文件的工具软件,能够实现二进制查看、格式转换、排序及合并等功能,结合sam格式中的flag、tag等信息,还可以完成比对结果的统计汇总。同时利用linux中的grep、awk等操作命令,还可以大大扩展samtools的使用范围与功能。
根据提示输入enter或者yes,完成安装,重启cmd,就可以正常使用
检查是否安装完成。
(2).添加镜像
conda config –add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config –add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config –add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config –set show_channel_urls yes
(3).输入命令,等待安装完成
完成后重新启动,检查一下
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