基因组——基因组的转录

基因组——基因组的转录本文探讨了基因组活性的瞬时和永久性变化 包括基因重排 染色质结构的影响及基因反馈机制

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5.1 基因组活性的瞬时可逆变化

直接作用/j间接作用:
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转录机器:增强子、调控子,转录因子(调控元件)
转录TF调控因子
磷酸化途径:
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小分子(第二信使)扩散:
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5.2基因组表达活性的永久性和半永久性变化

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1 基因组重排;

2染色质结构引起的基因组活性改变;

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多疏蛋白/DSP背开关蛋白:招募附近的染色体被组蛋白包裹,形成异染色质(不易转录) /常染色质

3由基因组反馈引起的基因组活性改变。

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MyoD转录调控因子

1.1抗体产生—基因重排(永久性):在这里插入图片描述

5.3 基因的转录本和转录组

基因的转录本剪切——

转录谱:

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5.4 转录组的检测与解析

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RNA的测序->cDNA的测序,实质是DNA测序。
5.4.1基于序列分析比对的转录组检测解析—– 表达序列标签分析技术(EST)
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5.4.1基于序列分析比对的转录组检测解析—– 基因表达序列分析技术(SAGE)
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5.4.2基于微阵列或芯片杂交分析的转录组检测解析—– 定性

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5.4.2基于微阵列或芯片杂交分析的转录组检测解析—– 定量
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基因:mRNA=1:5
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5.5转录组的动态差异性
顺式调控元件,反式因子(蛋白质转录调控因子/调控元件)
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基于控制元件+报告基因检测待测基因:
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5.6 基因组与转录组之间的差异性检测

碱基与碱基之间非随机的变化

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基因的转录组差示克隆(检测癌与非癌或者其它两种组织间的差异基因)
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